คณะฯ ได้จัดตั้งตามแผนแม่บทเดิมของมหาวิทยาลัยบูรพา วิทยาเขตสระแก้ว ที่จะผลิตบัณฑิตทางด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีที่เกี่ยวข้องกับการเกษตร เช่น สาขาวิชาทางด้านอุตสาหกรรมเกษตร เทคโนโลยีเกษตรทรัพยากรธรรมชาติ และสิ่งแวดล้อม จึงมีการผลักดันให้เกิดเป็นโครงการจัดตั้งคณะเทคโนโลยีการเกษตรขึ้น ในปี พ.ศ. 2549 และได้รับการประกาศจัดตั้งเป็นคณะฯ อย่างเป็นทางการ ตามประกาศสภามหาวิทยาลัยบูรพา เมื่อวันที่ 27 พฤศจิกายน พ.ศ. 2550 โดยมีวัตถุประสงค์ดังนี้
     1) ดำเนินการด้านการเรียนการสอนทางด้านวิทยาศาสตร์เกษตร ผลิตบัณฑิต ที่มีความรู้ความสามารถในการแข่งขันระดับนานาชาติ มีคุณธรรม จริยธรรม และจรรยาบรรณ
         ในวิชาชีพ
     2) ส่งเสริมการวิจัย เพื่อสร้างผลงาน และสร้างองค์ความรู้ใหม่ที่เป็นประโยชน์ต่อการศึกษาที่นำไปสู่การพัฒนานวัตกรรมและการกำหนดนโยบายเพื่อการพัฒนาการเกษตร
         การจัดการทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมที่ยั่งยืน
     3) ให้บริการวิชาการขยายการบริการวิชาการที่นำไปสู่การพึ่งตนเอง ปรับปรุงรูปแบบการถ่ายทอดวิชาการ ที่สามารถตอบสนองต่อความต้องการของท้องถิ่นทุกระดับอย่าง
         มีประสิทธิภาพ
     4) ส่งเสริมให้นักศึกษาและบุคลากร ตระหนักถึงความสำคัญของศิลปวัฒนธรรม เพื่ออนุรักษ์ความเป็นท้องถิ่นและประเทศชาติ
     5) รองรับการเจริญเติบโตของหน่วยงานและเพิ่มความคล่องตัวในการบริหารจัดการองค์กร ให้สอดคล้องกับจำนวนนักศึกษาและภารกิจในด้านต่าง ๆ ในอนาคต